2012年度预计总收入124,430万元，其中财政拨款收入84,365万元，教育收费收入33,850万元，其他收入6,215万元.
    2012年度预计总支出 124,430 万元，其中基本支出合计56,660万元（人员经费支出35,148万元，公用经费支出21,512万元），项目支出67,770万元（财政拨款专项27,705万元，利用高等学校学费收入安排补充人员经费、补充公用经费、离退休人员共享费专项共计33,850万元），其他资金安排补充公用经费6,215万元。

2012年度实际总收入为184,855万元，总支出为187,670万元，全年收支结余为 -2,815万元。其中：事业结余-3,159万元、科研事业结余2,029万元、专款结余 -1,685万元。

2012年度全年收入中，财政拨款83,125万元；教育收费收入37,004万元；其他净收入4,015万元；拨入专款收入28,510万元；科研事业收入30,974万元；经营收入1,227万元。

2012年度支出中，事业支出127,304万元（其中：人员性支出73,220万元；公用性支出29,528万元；专项支出24,556万元）；

专款支出30,195万元，主要用于：2012年度地方高校发展专项、"211工程"三期建设、教委重点学科建设、教育高地项目、优秀青年教师科研专项、科研创新、研究生大学生创新项目、博士后流动站、国家及上海市政府奖助学金、博士研究生普通奖学金、留学生经费、学生副食品补贴、高等教育内涵建设等各类专款支出。

科研事业支出28,944万元（其中国家级项目支出8,337万元，省（市）部级项目支出5,983万元，其他项目支出14,624万元）；